曆史沿革
2003-03-17 2003年3月17日，浙江省委書記習近平率浙江省黨政代表團赴清華大學，商討共建浙江清華長三角研究院事宜。 2003-12-31 浙江省人民政府与清華大學共建浙江清华长三角研究院签约仪式在杭州黄龙饭店举办。省委书记、省人大常委会主任习近平和清華大學黨委书记陈希分别讲话。省长吕祖善和清華大學校长顾秉林在协议书上签字。 2005-04-10 研究院總部大樓——創新大廈舉行奠基儀式，浙江省委書記習近平、清華大學校長顧秉林爲大樓揭牌。
2008-03-06 2008年3月6日，浙江清華長三角研究院與甯波市鄞州區人民政府簽署全面合作備忘錄，拉開研究院甯波院區建設尾声。 2008-06-05 2008年6月5日，浙江清華長三角研究院與杭州市蕭山區人民政府合作簽約，共同建立研究院杭州院區——蕭山生物工程中心。 2008-12-22 研究院總部大樓落成典禮在浙江省嘉興市隆重舉行。時任中共浙江省委書記、省人大常委會主任趙洪祝，時任省委副書記、省長呂祖善，清華大學校長顧秉林等省校領導出席典禮。 2014-08-16 2014年8月16日，浙江清華長三角研究院杭州分院共建協議簽約儀式在杭州市江幹區舉行，杭州市人民政府、浙江清華長三角研究院、江幹區人民政府將合作共建杭州分院。 2015-06-11 2015年6月11日，由浙江清華長三角研究院發起設立的浙華紫荊母基金注冊成立。
2015-11-20 2015年11月20日，研究院與台州市簽訂共建浙江清華長三角研究院台州創新中心框架協議。 2016-03-14 浙江省與清華大學新一輪省校戰略合作協議在京簽署。 2016-06-07 全國首家專業科技保險公司“太平科技保險有限公司”獲批並落戶研究院。 2016-09-28 本院發起的國資委首家金融資産交易所“南湖金融資産交易中心”獲批。
2016-09-29 本院台州創新中心挂牌成立。
2017-02-10 浙江未來技術研究院正式簽約成立，獲得國家技術發明一等獎的VR/AR項目落戶嘉興市南湖區。
2017-08-19 由本院發起的清華浙江柔性電子技術研究院揭牌成立。 2017-08-23 本院甯波分院成立。 2018-01-20 本院發起的浙江未來技術研究院落成。 2018-06-22 總部院區三期工程正式開工。 2018-06-26 研究院獲批設立國家海外人才離岸創新創業基地。 2018-10-19 浙江省與清華大學“深化省校合作，推動新時代創新驅動發展戰略”合作備忘錄在杭簽署。